历时十年 人类微生物组学研究公布三项成果(2)

2019-08-27  未知 admin

斯坦福大学基因组学和个体化医药中心主任Michael Snyder教授带领研究小组对106名健康人和糖尿病前期个体展开了为期4年的研究，分析转录组、代谢组、细胞因子和蛋白质组的变化以及微生物组的改变来揭示分子变化、遗传变化和微生物变化。他们发现，像白细胞介素-1受体激动剂（IL-1RA）和超敏C-反应蛋白（CRP）炎症标记物与特定的免疫信号传导可以作为发病前的个人分子特征，提示早期疾病发展的规律。

另一篇发表在《自然-医学》上的论文描述了阴道微生物对于早产风险的影响。

早产指的是妊娠不足37周胎儿出生。全世界每年有1500万早产儿，早产发生率超过10%。早产是新生儿死亡的重要原因。

弗吉尼亚联邦大学Gregory Buck教授及同事在1,527名孕妇的整个孕期内展开研究，通过对16S核糖体RNA、宏基因组、元转录组和细胞因子谱的分析，揭示了与早产风险相关的阴道微生物组变化。例如，早产孕妇的卷曲乳杆菌（Lactobacillus crispatus）水平低于足月妊娠的孕妇，还有多种细菌则过量存在。这些发现将有助于为提前预测早产提供指导。

▲怀孕和早产情况下阴道微生物组和宿主因子之间的关系示意图（图片来源：Nature）

同期《自然》上还刊发了iHMP项目负责人、美国国立卫生研究院的Lita Proctor博士的评论。展望下一个十年，她说：“我认为，只有当我们不再只是去知道微生物的物种名称分类，而开始理解微生物之间和微生物与宿主之间复杂多变的生态关系和演化关系，才会促进我们找到治疗糖尿病、癌症和自身免疫疾病的干预措施。”

人类微生物组的前期研究让我们在最近十多年认识到，微生物组是我们重要的“终身伴侣”。现在，通过生态学、微生物学、生物医学、计算机生物学等多学科跨领域的合作，我们将会更好地了解如何让我们和这些终身伴侣保持良好的关系，相互照顾，共同幸福。

参考资料

[1] The Integrative Human Microbiome Project. Nature. Doi: 10.1038/s41586-019-1238-8

[2] Jason Lloyd-Price et al., (2019) Multi-omics of the gut microbial ecosystem in inflammatory bowel diseases. Nature. Doi: 10.1038/s41586-019-1237-9

[3] Wenyu Zhou et al., (2019) Longitudinal multi-omics of host–microbe dynamics in prediabetes. Nature. Doi: 10.1038/s41586-019-1236-x

[4]Jennifer M. Fettweis et al., (2019) The vaginal microbiome and preterm birth. Nature Medicine. Doi: 10.1038/s41591-019-0450-2

[5] Lita Proctor. (2019) What’s next for the human microbiome? Nature. Doi: 10.1038/d41586-019-01654-0

原标题

今日《自然》封面：十多年跑到新终点，人类微生物组学研究公布三项成果