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人工智能如何让老药达到新高度?(3)

2019-05-10  未知 admin

GNS Healthcare公司的创始人兼首席执行官Colin Hill先生就是构筑这些算法系统的工程师之一。他在麻省剑桥创建的公司已经花了18年的时间开发一种称为REFS的计算机系统。GNS公司已经从安进(Amgen)公司的风投部和新基公司,以及其它投资人那里募集了3800万美元,致力于构建和调试疾病的计算机模型。在最近发表的一系列研究中,GNS详细描述了REFS系统模拟像帕金森病这样的复杂疾病时表现出的潜力。

帕金森病是一种非常复杂的神经退行性疾病,它的复杂性和导致疾病的多效性因子让已有疗法的疗效非常不一致。然而对于帕金森病来说,基因缺陷导致的一系列网络相互作用具有特定的特征,而且运动能力的破坏是疾病进展最可靠的指标。通过将帕金森病患者和健康对照组的遗传信息导入REFS系统,它可以帮助GNS生成超过100个计算机模型,预测导致运动功能恶化的机制。这些模型可以帮助发现原先未知的基因突变,它们可能加快疾病恶化速度。

这只是这一模型的第一步应用。使用这些发现,GNS能够让计算机模拟5000种不同的随机对照临床试验,每一个临床试验用来预测不同治疗方法会带来什么样的疾病进展。这种迅速的检测比用真正人类临床对照试验来获得同样的结果要迅速得多。GNS公司已经与其它医药企业达成合作,应用类似的手法来筛选治疗糖尿病、ALS、多发性骨髓瘤、和乳腺癌等疾病的潜在疗法。

“我们现在具有了在计算机上创建人类患者和疾病的替代模型的能力。我们可以使用它们来对每一个药物进行检测,并且预测哪些疗法会对什么样的患者有效。”Colin Hill先生说。

这种模拟已经不再只是发现相关性。它在回答因果性的问题。如果我们将药物甲给与了特定患者,而不是药物乙,会发生什么?能够模拟并且回答这种假想问题的能力是AI领域最近才出现的新进展。根据GNS公司的技术顾问,加州大学洛杉矶分校的计算机教授和AI资深研究人员Judea Pearl博士的描述,真正的智能需要从发现规律的层面上再进一步,能够基于这些规律进行分析,推断出假想情况下会发生什么。数据本身如果与机制相关的任何理念脱节,就不能提供任何真正的洞见。

2000到3的筛选过程,AI重新定义“药物发现”

再回到Pharnext公司的例子,Cohen博士对Pharnext公司的前景十分看好。同时他也很清楚地认识到AI技术的局限性。谷歌的人工智能AlphaZero在不需要借助任何人类棋谱的情况下,可以在围棋比赛中能够战胜世界的顶尖人类棋手。然而,Cohen博士指出,围棋的规则并不复杂,AlphaZero能够完全掌握这些规则。而在生物学领域,因为多效性的存在,我们还不了解,可能永远不能了解所有的规则。

然而,精心设计的AI系统能够让Pharnext根据已知的规则来构建模型并且依靠它们来做出选择。从10000个已知药物中,药物开发模型选出了2000种专利已经过期,并且已经上市的药物,这些药物已经被监管机构认为有效和安全。

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